儿童初始感染肺炎支原体后，肺炎支原体可在呼吸道存活数月甚至更久，主要是因其可牢牢黏附于气道上皮细胞，甚至侵入气道上皮细胞内，形成无症状隐性感染状态，即使给予足量抗生素治疗，在感染后2天至7个月（平均7周）时间内仍可检测到鼻咽部支原体抗体。因此肺炎支原体感染后需要足量足疗程治疗。